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真菌毒素，又稱霉菌毒素，是指霉菌在其所污染食品中產生的有毒代謝產物，廣泛污染農作物、食品及飼料等植物源性產品，一般會通過進食的方式進入人或動物體內，會引起人類和動物急性或慢性中毒，進而損害機體的肝臟、腎臟、神經組織等，對人類健康造成極大威脅。常見的真菌霉素有黃曲霉毒素、嘔吐毒素、玉米赤霉烯酮、赭曲霉毒素、伏馬菌素等。

目前，世界各國對糧食中各種毒素的限量和檢測手段都趨于嚴格。2017年國家衛生和計劃生育委員會發布了《食品安全國家標準食品中真菌毒素限量》標準，分別在谷物及其制品、水果及其制品、豆類及其制品、堅果及籽類、油脂及其制品、調味品、酒類、飲料類、特殊膳食用食品、乳及乳制品等10個領域作出限量要求。除了國家標準外，各行業也制定了相應的標準來用于市場監測管理，來確保食品安全。

一直以來，真菌毒素都是監控的重點項目，如何更快速的從各種檢測目標物中檢測出多種毒素，也是目前的重點需求。

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